Образована решением Священного Синода от 27-28 декабря 2011 г. (журнал № 175) путем выделения из состава Новосибирской епархии с кафедральным центром в г. Куйбышев, именовавшемся до 1935 г. Каинском. Включена в состав Новосибирской митрополии.

Правящему архиерею Синод постановил иметь титул Каинский и Барабинский.

Объединяет приходы в административных границах Барабинского, Венгеровского, Каргатского, Коченевского, Куйбышевского, Кыштовского, Северного, Татарского, Чановского, Чулымского, Убинского и Усть-Таркского районов Новосибирской области.